Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PRO3YER023W 861 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SCW4YGR279C 1161 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 MSA2YKR077W 1092 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 MTQ1YNL063W 945 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SNT2YGL131C 4212 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 WHI4YDL224C 1950 nt6.24□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 CLB2YPR119W 1476 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SHE10YGL228W 1734 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 URA7YBL039C 1740 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 GON7YJL184W 372 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 COS9YKL219W 1224 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YET2YMR040W 483 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 TUL1YKL034W 2277 nt6.23□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 UGO1YDR470C 1509 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SLO1YER180C-A 258 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YGR182CYGR182C 354 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 CTR2YHR175W 570 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 REX3YLR107W 1215 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 SCP1YOR367W 603 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YPR195CYPR195C 330 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 ROG3YFR022W 2202 nt6.22□□□□□ -1.41
CLF1Q12309 YJR015WYJR015W 1533 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RPL7AYGL076C 735 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YLR194CYLR194C 765 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 TIF34YMR146C 1044 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 CBC2YPL178W 627 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RPL7BYPL198W 735 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 ARR1YPR199C 885 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 KTR3YBR205W 1215 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 PIF1YML061C 2580 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 STL1YDR536W 1710 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 PTK2YJR059W 2457 nt6.21□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 KEX2YNL238W 2445 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YLH47YPR125W 1365 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 QRI1YDL103C 1434 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YCR099CYCR099C 468 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 SRG1SRG1 551 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 PHM8YER037W 966 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YGR066CYGR066C 879 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 VMA16YHR026W 642 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 NPT1YOR209C 1290 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 AMA1YGR225W 1782 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RKM4YDR257C 1485 nt6.2□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 SRV2YNL138W 1581 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 SAS4YDR181C 1446 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 HSF1YGL073W 2502 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RTT103YDR289C 1230 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YLR317WYLR317W 435 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 HEM15YOR176W 1182 nt6.19□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 UPS3YDR185C 540 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RPT6YGL048C 1218 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RRT7YLL030C 342 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YOL131WYOL131W 327 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 HSP26YBR072W 645 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 NUP1YOR098C 3231 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 MPC54YOR177C 1395 nt6.18□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 CLB1YGR108W 1416 nt6.17□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 MHR1YDR296W 681 nt6.17□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 SPO12YHR152W 522 nt6.17□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 TAX4YJL083W 1815 nt6.17□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 BUD14YAR014C 2130 nt6.17□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 ADE13YLR359W 1449 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 HXT5YHR096C 1779 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 GUA1YMR217W 1578 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YLR311CYLR311C 348 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 NMD4YLR363C 657 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RBD2YPL246C 789 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 UTP7YER082C 1665 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YHR045WYHR045W 1683 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 GEP3YOR205C 1671 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 PWP1YLR196W 1731 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 RPT1YKL145W 1404 nt6.16□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 QDR3YBR043C 2070 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 snR57snR57 88 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 CHO1YER026C 831 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 LDB18YLL049W 540 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YLR036CYLR036C 612 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 ERG3YLR056W 1098 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 YOR318CYOR318C 306 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 UBC4YBR082C 447 nt6.15□□□□□ -1.42
CLF1Q12309 NTH2YBR001C 2343 nt6.15□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 HIR1YBL008W 2523 nt6.15□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 ACS2YLR153C 2052 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MAL11YGR289C 1851 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 PNP1YLR209C 936 nt6.14□□□□□ -1.43
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