Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 SSK22YCR073C 3996 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 UBX2YML013W 1755 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 RIM101YHL027W 1878 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 EFM4YIL064W 774 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YKL223WYKL223W 333 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 DCN1YLR128W 810 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 SSZ1YHR064C 1617 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YMD8YML038C 1329 nt4.63□□□□□ -1.67
USB1Q12208 SYN8YAL014C 768 nt4.62□□□□□ -1.67
USB1Q12208 MNN2YBR015C 1794 nt4.62□□□□□ -1.67
USB1Q12208 ULA1YPL003W 1389 nt4.62□□□□□ -1.67
USB1Q12208 HXT3YDR345C 1704 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YJR115WYJR115W 510 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 COS9YKL219W 1224 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 SEC9YGR009C 1956 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 KDX1YKL161C 1302 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 DBF4YDR052C 2115 nt4.61□□□□□ -1.67
USB1Q12208 PEX19YDL065C 1029 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 DBP8YHR169W 1296 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YJL193WYJL193W 1209 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 NPT1YOR209C 1290 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 HFI1YPL254W 1467 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 BRF1YGR246C 1791 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 RFA1YAR007C 1866 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 PMT2YAL023C 2280 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 MBP1YDL056W 2502 nt4.6□□□□□ -1.67
USB1Q12208 ADY2YCR010C 852 nt4.59□□□□□ -1.67
USB1Q12208 NQM1YGR043C 1002 nt4.59□□□□□ -1.67
USB1Q12208 TOS4YLR183C 1470 nt4.59□□□□□ -1.67
USB1Q12208 YLH47YPR125W 1365 nt4.59□□□□□ -1.67
USB1Q12208 KIP2YPL155C 2121 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YEL077CYEL077C 3834 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 DAL3YIR032C 588 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 LEM3YNL323W 1245 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RET1YOR207C 3450 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YFL034WYFL034W 3222 nt4.58□□□□□ -1.68
USB1Q12208 QDR1YIL120W 1692 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 VHS2YIL135C 1311 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 GCS1YDL226C 1059 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YDR053WYDR053W 396 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 KTR3YBR205W 1215 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 HPC2YBR215W 1878 nt4.57□□□□□ -1.68
USB1Q12208 SUM1YDR310C 3189 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RPT4YOR259C 1314 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 IPK1YDR315C 846 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RPL12AYEL054C 498 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 CAX4YGR036C 720 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 ROX3YBL093C 663 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YTA12YMR089C 2478 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YGL036WYGL036W 2730 nt4.56□□□□□ -1.68
USB1Q12208 MLC1YGL106W 450 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 MND2YIR025W 1107 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 ELA1YNL230C 1140 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RPA49YNL248C 1248 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 ARG1YOL058W 1263 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RDL1YOR285W 420 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 STE50YCL032W 1041 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 ARN1YHL040C 1884 nt4.55□□□□□ -1.68
USB1Q12208 TOS3YGL179C 1683 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 DPH2YKL191W 1605 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RPS16BYDL083C 432 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YLR118CYLR118C 684 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YLR346CYLR346C 306 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 TIM54YJL054W 1437 nt4.54□□□□□ -1.68
USB1Q12208 PXA1YPL147W 2613 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 PHO8YDR481C 1701 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 URA7YBL039C 1740 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 TRP1YDR007W 675 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 RML2YEL050C 1182 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 CBF1YJR060W 1056 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 SCO1YBR037C 888 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 NOT3YIL038C 2511 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 OCA5YHL029C 2040 nt4.53□□□□□ -1.68
USB1Q12208 EEB1YPL095C 1371 nt4.53□□□□□ -1.69
USB1Q12208 ASK10YGR097W 3441 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 ARP2YDL029W 1176 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YFL064CYFL064C 525 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 MRF1YGL143C 1242 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YPT32YGL210W 669 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 MTW1YAL034W-A 870 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YKL151CYKL151C 1014 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YLR194CYLR194C 765 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 SEC13YLR208W 894 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 MDY2YOL111C 639 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YPR202WYPR202W 717 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 UGA1YGR019W 1416 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 SIA1YOR137C 1869 nt4.52□□□□□ -1.69
USB1Q12208 APE1YKL103C 1545 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 PDC1YLR044C 1692 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 VTC2YFL004W 2487 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 ICE2YIL090W 1476 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 FUM1YPL262W 1467 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 SLO1YER180C-A 258 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 YGR182CYGR182C 354 nt4.51□□□□□ -1.69
USB1Q12208 POM33YLL023C 840 nt4.51□□□□□ -1.69
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