Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YEL028WYEL028W 462 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 FZF1YGL254W 900 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 IRC9YJL142C 393 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 CMS1YLR003C 876 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 FSF1YOR271C 984 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 CRF1YDR223W 1404 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YPR196WYPR196W 1413 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 GAA1YLR088W 1845 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 PMP3YDR276C 168 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 DCV1YFR012W 609 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 ECM14YHR132C 1293 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 IST3YIR005W 447 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 TFA2YKR062W 987 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 PSR1YLL010C 1284 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RRT1YBL048W 312 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YLR345WYLR345W 1530 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 KNS1YLL019C 2214 nt6.49□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 CBS2YDR197W 1170 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 IMP3YHR148W 552 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 VPS24YKL041W 675 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YLR194CYLR194C 765 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 REX4YOL080C 870 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 LDH1YBR204C 1128 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 ATF1YOR377W 1578 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 VMA2YBR127C 1554 nt6.48□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YDR514CYDR514C 1452 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 TRS23YDR246W 660 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YDR278CYDR278C 318 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RTT103YDR289C 1230 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 NCS6YGL211W 1080 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 ARD1YHR013C 717 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RPB4YJL140W 666 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 SRY1YKL218C 981 nt6.47□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF3Q07807 YBL036CYBL036C 774 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 ISC1YER019W 1434 nt6.47□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 PMT2YAL023C 2280 nt6.46□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 DRS1YLL008W 2259 nt6.46□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 SEC72YLR292C 582 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 PRE7YBL041W 726 nt6.46□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MRPS17YMR188C 714 nt6.46□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 GRX5YPL059W 453 nt6.46□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 RRF1YHR038W 693 nt6.45□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 GTT1YIR038C 705 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 CPR7YJR032W 1182 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 LAC1YKL008C 1257 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 RRT7YLL030C 342 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YOR024WYOR024W 324 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 SFG1YOR315W 1041 nt6.45□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 TFC7YOR110W 1308 nt6.45□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 JIP4YDR475C 2631 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 RRP9YPR137W 1722 nt6.45□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YTP1YNL237W 1380 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YFR006WYFR006W 1608 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YCK1YHR135C 1617 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 ERV14YGL054C 417 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YGR016WYGR016W 573 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MND2YIR025W 1107 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 LDS1YAL018C 978 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 USB1YLR132C 873 nt6.44□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 CPR6YLR216C 1116 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 GPM3YOL056W 912 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MED8YBR193C 672 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 ERG1YGR175C 1491 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 AVT4YNL101W 2142 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YJR124CYJR124C 1347 nt6.44□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPK3YBR028C 1578 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 LPL1YOR059C 1353 nt6.44□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 TPO3YPR156C 1869 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 BCY1YIL033C 1251 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 ECM1YAL059W 639 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YLR456WYLR456W 615 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YPL162CYPL162C 822 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MET16YPR167C 786 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 PBI1YPL272C 1554 nt6.43□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 IMA5YJL216C 1746 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 NOG2YNR053C 1461 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YLL067CYLL067C 3618 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 IES1YFL013C 2079 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 POP6YGR030C 477 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 CIS3YJL158C 684 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 NTR2YKR022C 969 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 IRC25YLR021W 540 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 REH1YLR387C 1299 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 ATG16YMR159C 453 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 INP1YMR204C 1263 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YMR295CYMR295C 594 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YBL062WYBL062W 381 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 CKB2YOR039W 777 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 APA1YCL050C 966 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 WTM1YOR230W 1314 nt6.42□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 PAP2YOL115W 1755 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 PET112YBL080C 1626 nt6.41□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 MAK31YCR020C-A 267 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 RPT3YDR394W 1287 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 DOM34YNL001W 1161 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 CPR8YNR028W 927 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YPR123CYPR123C 435 nt6.41□□□□□ -1.38
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