Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC9Q06265 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EXOSC9Q06265 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EXOSC9Q06265 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms