Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUD4Q01804 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUD4Q01804 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms