Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX1Q01196 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RUNX1Q01196 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms