Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2IP78347 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2IP78347 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IP78347 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms