Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSNK2A1P68400 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CSNK2A1P68400 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms