Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP54P61011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRP54P61011 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP54P61011 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP54P61011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRP54P61011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP54P61011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRP54P61011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP54P61011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRP54P61011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRP54P61011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRP54P61011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP54P61011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP54P61011 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRP54P61011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRP54P61011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRP54P61011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRP54P61011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRP54P61011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRP54P61011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms