Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTTPP55157 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTTPP55157 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTTPP55157 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTTPP55157 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTTPP55157 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTTPP55157 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTTPP55157 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MTTPP55157 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTTPP55157 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTTPP55157 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTTPP55157 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTTPP55157 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTTPP55157 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTTPP55157 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms