Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS1P54277 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS1P54277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS1P54277 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS1P54277 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS1P54277 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS1P54277 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS1P54277 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS1P54277 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS1P54277 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS1P54277 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS1P54277 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS1P54277 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS1P54277 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS1P54277 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PMS1P54277 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PMS1P54277 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS1P54277 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS1P54277 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS1P54277 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS1P54277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS1P54277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS1P54277 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS1P54277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS1P54277 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS1P54277 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS1P54277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms