Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGT1BP53609 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGT1BP53609 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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