Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1P48651 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1P48651 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1P48651 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms