Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL28P46779 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL28P46779 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL28P46779 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL28P46779 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL28P46779 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL28P46779 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms