Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 GLO2YDR272W 825 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YDR541CYDR541C 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 TOM20YGR082W 552 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 RIM101YHL027W 1878 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 OSW5YMR148W 447 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 UBC4YBR082C 447 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 MMR1YLR190W 1476 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 RPN5YDL147W 1338 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 VPS70YJR126C 2436 nt5.44□□□□□ -1.54
SEC28P40509 MCX1YBR227C 1563 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SMF3YLR034C 1422 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YDL119CYDL119C 924 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 GIR2YDR152W 798 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SCW4YGR279C 1161 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 EGD2YHR193C 525 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YBL044WYBL044W 369 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 LST8YNL006W 912 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 ARR3YPR201W 1215 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 HAP1YLR256W 4509 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 KCH1YJR054W 1494 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 GEP3YOR205C 1671 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 ARN2YHL047C 1863 nt5.43□□□□□ -1.54
SEC28P40509 FOL1YNL256W 2475 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 CYK3YDL117W 2658 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YDL034WYDL034W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 RAM1YDL090C 1296 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 VCX1YDL128W 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YKR041WYKR041W 753 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 CAM1YPL048W 1248 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 MRPL36YBR122C 534 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SIS2YKR072C 1689 nt5.42□□□□□ -1.54
SEC28P40509 DED81YHR019C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YGR291CYGR291C 222 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 ECM1YAL059W 639 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 MTQ1YNL063W 945 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 CAR1YPL111W 1002 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SFB3YHR098C 2790 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SSZ1YHR064C 1617 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 HRP1YOL123W 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YGL185CYGL185C 1140 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 GSY2YLR258W 2118 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 GTR1YML121W 933 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SPS18YNL204C 903 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.4□□□□□ -1.54
SEC28P40509 ACF2YLR144C 2340 nt5.4□□□□□ -1.55
SEC28P40509 IMA1YGR287C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 ATE1YGL017W 1512 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 CAD1YDR423C 1230 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 NQM1YGR043C 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MRP17YKL003C 396 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 PML1YLR016C 615 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YOR292CYOR292C 930 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YHR045WYHR045W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 UBP7YIL156W 3216 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 HXT3YDR345C 1704 nt5.39□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YDR053WYDR053W 396 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 RPT6YGL048C 1218 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 CAB4YGR277C 918 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 TFS1YLR178C 660 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 GPM3YOL056W 912 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 AFT1YGL071W 2073 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 IML2YJL082W 2196 nt5.38□□□□□ -1.55
SEC28P40509 PMT2YAL023C 2280 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YAP1801YHR161C 1914 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 CWC21YDR482C 408 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YNL019CYNL019C 855 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YNL033WYNL033W 855 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 WTM1YOR230W 1314 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SOG2YOR353C 2376 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 CDC19YAL038W 1503 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 BRF1YGR246C 1791 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 RFA1YAR007C 1866 nt5.37□□□□□ -1.55
SEC28P40509 LAP2YNL045W 2016 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 GRX4YER174C 735 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 YJR085CYJR085C 318 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SNN1YNL086W 309 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 RPC19YNL113W 429 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 ECM33YBR078W 1290 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MTF2YDL044C 1323 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 MET3YJR010W 1536 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 RRN3YKL125W 1884 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 TUP1YCR084C 2142 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 EXO1YOR033C 2109 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SDA1YGR245C 2304 nt5.36□□□□□ -1.55
SEC28P40509 SEC39YLR440C 2130 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 HFI1YPL254W 1467 nt5.35□□□□□ -1.55
SEC28P40509 ADE13YLR359W 1449 nt5.35□□□□□ -1.55
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