Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALRP27797 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CALRP27797 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALRP27797 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALRP27797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALRP27797 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALRP27797 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALRP27797 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALRP27797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALRP27797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALRP27797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALRP27797 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALRP27797 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALRP27797 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALRP27797 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALRP27797 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CALRP27797 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.2 ms