Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATF7P17544 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF7P17544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF7P17544 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF7P17544 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATF7P17544 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF7P17544 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF7P17544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF7P17544 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF7P17544 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF7P17544 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF7P17544 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF7P17544 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF7P17544 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF7P17544 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF7P17544 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF7P17544 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF7P17544 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF7P17544 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF7P17544 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF7P17544 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF7P17544 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF7P17544 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms