Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-EP13747 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-EP13747 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-EP13747 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms