Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PABPC1P11940 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1P11940 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms