Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPN1P04843 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPN1P04843 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPN1P04843 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPN1P04843 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPN1P04843 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPN1P04843 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPN1P04843 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN1P04843 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN1P04843 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN1P04843 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPN1P04843 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPN1P04843 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RPN1P04843 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RPN1P04843 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPN1P04843 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPN1P04843 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms