Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN7O95471 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN7O95471 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.1 ms