Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
N4BP3O15049 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
N4BP3O15049 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms