Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3C2BO00750 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3C2BO00750 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PIK3C2BO00750 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3C2BO00750 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms