Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAD1O00515 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAD1O00515 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAD1O00515 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAD1O00515 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAD1O00515 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAD1O00515 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAD1O00515 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAD1O00515 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAD1O00515 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAD1O00515 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAD1O00515 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAD1O00515 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAD1O00515 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAD1O00515 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAD1O00515 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAD1O00515 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAD1O00515 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAD1O00515 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAD1O00515 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAD1O00515 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms