Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPIPA5E9PKD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPA5E9PKD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms