Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF25A6NGN4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF25A6NGN4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF25A6NGN4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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