Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A088AWK7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A088AWK7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms