Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN6Q9Y6Q1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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