Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP3Q9Y3E7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP3Q9Y3E7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP3Q9Y3E7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP3Q9Y3E7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms