Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A1Q9Y2Q0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms