Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAMD4AQ9UPU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD4AQ9UPU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms