Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO6Q9UM54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO6Q9UM54 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO6Q9UM54 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO6Q9UM54 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO6Q9UM54 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO6Q9UM54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms