Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERG28Q9UKR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERG28Q9UKR5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms