Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PODXL2Q9NZ53 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PODXL2Q9NZ53 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PODXL2Q9NZ53 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXL2Q9NZ53 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXL2Q9NZ53 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXL2Q9NZ53 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXL2Q9NZ53 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PODXL2Q9NZ53 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms