Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK12Q9NYV4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK12Q9NYV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK12Q9NYV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms