Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COA4Q9NYJ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COA4Q9NYJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1331.7 ms