Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX15Q9NRS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX15Q9NRS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX15Q9NRS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms