Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM9Q9NQV7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM9Q9NQV7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms