Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS4Q9NQG7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS4Q9NQG7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms