Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BPIFA1Q9NP55 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA1Q9NP55 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms