Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD8Q96LT4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD8Q96LT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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