Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDLIM2Q96JY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDLIM2Q96JY6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms