Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IL1Q8TBN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IL1Q8TBN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms