Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SVBPQ8N300 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SVBPQ8N300 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms