Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACE1Q8IYU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACE1Q8IYU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACE1Q8IYU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACE1Q8IYU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms