Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFXL1Q6ZNB6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFXL1Q6ZNB6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFXL1Q6ZNB6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms