Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR88Q6ZMY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR88Q6ZMY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
WDR88Q6ZMY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms