Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFCAB12Q6NXP0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFCAB12Q6NXP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms