Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP4R4Q6NUP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms