Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MALRD1Q5VYJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MALRD1Q5VYJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms